26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5209 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5209  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.767147  normal  0.342725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1595  hypothetical protein  47.04 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5237  hypothetical protein  47.04 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6243  hypothetical protein  48.47 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6530  hypothetical protein  43.27 
 
 		 345 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5588  hypothetical protein  44.03 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3365  hypothetical protein  38.57 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.75727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0697  domain of unknown function DUF1738  36.84 
 
 		 653 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4055  hypothetical protein  40.34 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2287  hypothetical protein  29.46 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1712  hypothetical protein  29.46 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1327  hypothetical protein  29.46 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0330254  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3385  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.81 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  26.83 
 
 		 827 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  24.08 
 
 		 709 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2564  hypothetical protein  27.86 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000782255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  23.91 
 
 		 673 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  34.62 
 
 		 523 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  25.16 
 
 		 569 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2727  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  24.34 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000895401  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  21.26 
 
 		 520 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  27.2 
 
 		 673 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  28.43 
 
 		 499 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3644  type I restriction enzyme R protein N terminus (HSDR_N)/N-6 DNA methylase  30.43 
 
 		 866 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  24.07 
 
 		 808 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  24.39 
 
 		 405 aa  42  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>