More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5196 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  100 
 
 		 549 aa  1106    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6529  parB-like partition protein  31.84 
 
 		 555 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5020  parB-like partition protein  33.69 
 
 		 591 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  30.63 
 
 		 564 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  46.28 
 
 		 554 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  46.28 
 
 		 554 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6241  ParB family protein  43.87 
 
 		 574 aa  203  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1591  ParB family protein  43.65 
 
 		 587 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0914719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5589  parB-like partition protein  45.04 
 
 		 559 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  42.51 
 
 		 583 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2542  ParB family protein  45.61 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.411196 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4412  parB-like partition proteins  29.57 
 
 		 580 aa  187  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5053  ParB family protein  40.08 
 
 		 582 aa  180  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5341  ParB family protein  41.53 
 
 		 569 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0017765  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  38.98 
 
 		 607 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  43.33 
 
 		 294 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  38.46 
 
 		 272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.32 
 
 		 274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  33.63 
 
 		 286 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  31.94 
 
 		 668 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  39.44 
 
 		 299 aa  110  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1601  parB-like partition protein  29.83 
 
 		 864 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  33.62 
 
 		 326 aa  109  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  41.56 
 
 		 307 aa  108  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  36.07 
 
 		 317 aa  107  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  37.14 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  37.75 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  42.11 
 
 		 304 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.81 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  34.05 
 
 		 283 aa  104  5e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  35.53 
 
 		 291 aa  104  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  35.39 
 
 		 305 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  34.26 
 
 		 294 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  36.87 
 
 		 288 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  35.64 
 
 		 281 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  36.87 
 
 		 290 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  33.58 
 
 		 597 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  37.7 
 
 		 299 aa  102  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  35.08 
 
 		 289 aa  101  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  33.67 
 
 		 290 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  36.13 
 
 		 290 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  35.8 
 
 		 301 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  39.8 
 
 		 298 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  32.21 
 
 		 283 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  28.4 
 
 		 286 aa  100  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  28.4 
 
 		 286 aa  100  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  35.6 
 
 		 290 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  35.03 
 
 		 300 aa  100  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  32.79 
 
 		 278 aa  100  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  32.42 
 
 		 279 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  34.17 
 
 		 304 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  35.61 
 
 		 300 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  34.97 
 
 		 294 aa  99.8  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  37.71 
 
 		 303 aa  99.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  36.18 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  33.51 
 
 		 290 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  34.55 
 
 		 290 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  35.61 
 
 		 296 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  34.55 
 
 		 290 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  32.84 
 
 		 290 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  32.07 
 
 		 283 aa  98.2  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  32.07 
 
 		 307 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  34.72 
 
 		 292 aa  98.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  36.99 
 
 		 309 aa  98.2  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  33.5 
 
 		 281 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  34.59 
 
 		 283 aa  98.2  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  30.99 
 
 		 286 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  35.68 
 
 		 305 aa  97.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  36.27 
 
 		 295 aa  97.8  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  36.04 
 
 		 297 aa  97.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  34.03 
 
 		 294 aa  97.4  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  36.04 
 
 		 297 aa  97.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  33.84 
 
 		 280 aa  97.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  32.34 
 
 		 290 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  35.12 
 
 		 301 aa  97.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  31.86 
 
 		 296 aa  97.1  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  36.04 
 
 		 305 aa  97.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  35.33 
 
 		 289 aa  96.7  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  36.04 
 
 		 310 aa  96.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  33.5 
 
 		 279 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  37.32 
 
 		 281 aa  96.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  33.5 
 
 		 279 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  35 
 
 		 272 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  32.46 
 
 		 290 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  34.59 
 
 		 283 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  37.99 
 
 		 290 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  37.99 
 
 		 290 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  33.18 
 
 		 269 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  33.69 
 
 		 283 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  34.05 
 
 		 283 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  37.17 
 
 		 290 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  33.69 
 
 		 256 aa  95.1  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  37.17 
 
 		 290 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  33.69 
 
 		 283 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  37.17 
 
 		 290 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  35.23 
 
 		 306 aa  95.1  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  37.17 
 
 		 290 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  33.16 
 
 		 283 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  34.04 
 
 		 294 aa  94.7  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  30.98 
 
 		 281 aa  94.7  4e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>