203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5190 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5190  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.533774 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7826  transcriptional regulator, MucR family  44.51 
 
 		 174 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  44.08 
 
 		 175 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  43.04 
 
 		 168 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0188  MucR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 162 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17325  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  44.81 
 
 		 160 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  46 
 
 		 166 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2438  ROSMUCR transcriptional regulator  46.85 
 
 		 143 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.634995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  44.17 
 
 		 174 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  43.59 
 
 		 189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  45.86 
 
 		 145 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 185 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 164 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  44.74 
 
 		 162 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  44.74 
 
 		 162 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  42.59 
 
 		 174 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  44.94 
 
 		 178 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  43.85 
 
 		 177 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2365  transcriptional regulator, MucR family  42.48 
 
 		 176 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4811  transcriptional regulator, MucR family  40.65 
 
 		 166 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4896  MucR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 180 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127609  hitchhiker  0.00352911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 169 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  44.3 
 
 		 143 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 174 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  43.62 
 
 		 177 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 137 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  46.26 
 
 		 134 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0068  transcriptional regulator, MucR family  42.25 
 
 		 174 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  46.31 
 
 		 160 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 142 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  47.92 
 
 		 150 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 164 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 137 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  39.74 
 
 		 165 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 143 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  44 
 
 		 162 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  47.92 
 
 		 139 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 138 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0270  transcriptional regulator, MucR family  45.07 
 
 		 153 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  41.57 
 
 		 185 aa  109  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 143 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 174 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3787  ROSMUCR transcriptional regulator  43.92 
 
 		 140 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 179 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  45.33 
 
 		 134 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 139 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  44.37 
 
 		 162 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  41.18 
 
 		 166 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 171 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1345  transcriptional regulator, MucR family  41.83 
 
 		 166 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000373643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  44.44 
 
 		 140 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 145 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  39.61 
 
 		 137 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  44.97 
 
 		 135 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5176  MucR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 190 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  42.86 
 
 		 175 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  44.14 
 
 		 141 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  42.86 
 
 		 175 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3504  transcriptional regulator, MucR family  40.13 
 
 		 131 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 156 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  43.54 
 
 		 159 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 133 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 143 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 155 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 166 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1889  MucR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 156 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 143 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  39.22 
 
 		 133 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 137 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  45.14 
 
 		 164 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 141 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  43.66 
 
 		 160 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 158 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  40.28 
 
 		 172 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  41.61 
 
 		 171 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 155 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 144 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 183 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 143 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 154 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  39.07 
 
 		 173 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 159 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  40.26 
 
 		 138 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1667  MucR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 142 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3329  transcriptional regulator, MucR family  39.75 
 
 		 154 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1610  transcriptional regulator, MucR family  41.33 
 
 		 145 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5564  MucR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 156 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  39.55 
 
 		 177 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  42 
 
 		 145 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  37.58 
 
 		 176 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  37.58 
 
 		 176 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 138 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 145 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0997  MucR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 170 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1275  transcriptional regulator, MucR family  38.93 
 
 		 146 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 133 aa  99  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  41.45 
 
 		 141 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  46.1 
 
 		 147 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  99  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>