84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5169 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5169  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  100 
 
 		 109 aa  220  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0108263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3966  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  46.79 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  41.82 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0123  single-strand binding protein  39.82 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46256  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3178  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  38.05 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3167  single-strand binding protein  39.47 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.860724  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3361  single-strand binding protein  38.6 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437989  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5233  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  36.94 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.596941 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4966  single-strand binding protein  39.13 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0658  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0743  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.323458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6500  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157974  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  29.36 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6592  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130329  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  30.36 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  29.73 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 172 aa  47.8  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2133  single-strand binding protein  25.69 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000570292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2171  single-strand binding protein  25.69 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00228216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  31.53 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  31.53 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1081  single-stranded DNA-binding protein  32.43 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000301398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4276  single-strand binding protein  32.86 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.7148099999999997e-20  normal  0.751726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  30.63 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  27.68 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  26.61 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  28.83 
 
 		 157 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  28.83 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02018  single-stranded DNA binding protein  37.31 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  26.79 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  28.45 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  28.83 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  24.77 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  26.32 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  29.73 
 
 		 222 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  30 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  27.27 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  27.93 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  27.27 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  28.83 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  27.27 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  27.93 
 
 		 146 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  26.36 
 
 		 130 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 134 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  26.36 
 
 		 130 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  27.93 
 
 		 158 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  28.33 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  25.23 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  29.46 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  29.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  26.36 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  24.77 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  24.32 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  26.85 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  25.89 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  24.77 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  25.89 
 
 		 231 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  27.93 
 
 		 230 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  27.93 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  29.73 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  25.23 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 183 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4370  single-strand binding protein  30.97 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 184 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 184 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  24.32 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  27.68 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  26.79 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  26.79 
 
 		 172 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>