130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5150 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  100 
 
 		 399 aa  793    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  33.24 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  35.29 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  35.29 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  32.97 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4377  phage integrase family protein  27.55 
 
 		 371 aa  106  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0237  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  27.08 
 
 		 649 aa  96.3  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  34.07 
 
 		 311 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  27.47 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  29.06 
 
 		 342 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  33.21 
 
 		 307 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  28.36 
 
 		 314 aa  86.3  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  28.43 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  27.58 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  28.43 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  31.44 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  29.41 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  27.76 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  27.76 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  25.63 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  34.22 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  28.15 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  26.79 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  27.8 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  30.88 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  31.49 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  29.12 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.36 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  27.52 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  28.83 
 
 		 346 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  25.78 
 
 		 336 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  23.51 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  23.22 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  29.03 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  27.39 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  32.32 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  32.32 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  28.53 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  30.52 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  28.83 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  24.04 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  31.69 
 
 		 322 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  31.71 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  23.68 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  28.63 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  23.1 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  32.8 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  35.23 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  23.1 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  28.12 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  28.41 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  23.05 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  25 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  31.35 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  33.33 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  30.95 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  26.96 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  28.04 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  27.01 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02045  Site-specific recombinase XerD-like protein  23.48 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.317068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  32.48 
 
 		 338 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  27.36 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  27.32 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  31.65 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  29.57 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1279  integrase family protein  25.55 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  26.09 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2722  phage integrase family protein  34.07 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  26.2 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  28.81 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 292 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  28.29 
 
 		 308 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  27.55 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  26.71 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  28.99 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  28.24 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  22.37 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  22.94 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  28.96 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.08 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  26.25 
 
 		 380 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  25.87 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  33.33 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  25.65 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  32 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  25.98 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>