More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5138 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  88.1 
 
 
221 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  47.37 
 
 
252 aa  249  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  47.37 
 
 
252 aa  249  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  47.37 
 
 
252 aa  249  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  47.37 
 
 
252 aa  249  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  46.75 
 
 
255 aa  215  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  43.51 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  43.51 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  43.51 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  39.92 
 
 
248 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  41.22 
 
 
280 aa  198  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  44.02 
 
 
258 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  44.02 
 
 
258 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  42.79 
 
 
262 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  42.79 
 
 
262 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  42.79 
 
 
262 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  42.79 
 
 
262 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  42.79 
 
 
262 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  42.79 
 
 
262 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  41.92 
 
 
262 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  37.97 
 
 
252 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  37.97 
 
 
252 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  37.97 
 
 
252 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  37.97 
 
 
252 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  39 
 
 
256 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  40.87 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  40.87 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  40.85 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0248  transposase/IS protein  41.08 
 
 
281 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2334  transposase/IS protein  41.08 
 
 
281 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  41.08 
 
 
281 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0953  transposase/IS protein  41.08 
 
 
281 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.0557265 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0923  IstB domain protein ATP-binding protein  40.69 
 
 
273 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0943  IstB domain protein ATP-binding protein  40.69 
 
 
273 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0933  IstB domain protein ATP-binding protein  40.69 
 
 
273 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1245  IstB domain protein ATP-binding protein  40.69 
 
 
273 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1255  IstB domain protein ATP-binding protein  40.69 
 
 
273 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000529674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1998  IstB domain protein ATP-binding protein  40.69 
 
 
273 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1007  IstB domain protein ATP-binding protein  40.69 
 
 
273 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1257  IstB domain protein ATP-binding protein  40.69 
 
 
273 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00361337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2080  IstB domain protein ATP-binding protein  39.29 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00584299  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3470  IstB domain protein ATP-binding protein  39.29 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000505364  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3046  IstB domain protein ATP-binding protein  39.29 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000101378  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4394  IstB  76.79 
 
 
116 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0196  transposase/IS protein  40.66 
 
 
278 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183611 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5625  transposase  43.04 
 
 
274 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  40.85 
 
 
259 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  40.85 
 
 
259 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  40.85 
 
 
259 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  40.85 
 
 
259 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  40.08 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  40.08 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  40.08 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1004  IstB domain protein ATP-binding protein  38.7 
 
 
272 aa  179  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7662  transposase/IS protein  40.66 
 
 
279 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  41.1 
 
 
264 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  41.1 
 
 
264 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  41.1 
 
 
264 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  41.1 
 
 
264 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  41.1 
 
 
264 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  41.1 
 
 
264 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  41.1 
 
 
264 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  40.87 
 
 
277 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  40.87 
 
 
277 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  40.87 
 
 
277 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  40.87 
 
 
277 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  41.81 
 
 
274 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  41.81 
 
 
274 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  41.81 
 
 
274 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3716  IstB ATP binding domain-containing protein  37.19 
 
 
258 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0109  IstB ATP binding domain-containing protein  37.19 
 
 
258 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1008  IstB ATP binding domain-containing protein  37.19 
 
 
258 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.126896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1320  IstB ATP binding domain-containing protein  37.19 
 
 
258 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2855  IstB ATP binding domain-containing protein  37.19 
 
 
258 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  41.81 
 
 
274 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  43.78 
 
 
271 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5070  IstB ATP binding domain-containing protein  41.88 
 
 
287 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0047  transposase/IS protein  40.34 
 
 
264 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2594  transposase/IS protein  40.34 
 
 
264 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0285671  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  40.64 
 
 
265 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0800  IstB ATP binding domain-containing protein  69.23 
 
 
174 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2750  IstB-like ATP-binding protein  38.02 
 
 
241 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.512582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0320  transposase/IS protein  40.34 
 
 
264 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0341466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1117  transposase/IS protein  40.34 
 
 
264 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1788  transposase/IS protein  40.34 
 
 
264 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2273  transposase/IS protein  40.34 
 
 
264 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00636107  hitchhiker  0.00023895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2538  transposase/IS protein  40.34 
 
 
264 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000073065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2587  transposase/IS protein  40.34 
 
 
264 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2796  transposase/IS protein  40.34 
 
 
264 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3281  transposase/IS protein  40.34 
 
 
264 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423903  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  38.66 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  38.66 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  40.28 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  40.28 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1289  hypothetical protein  40.28 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2205  hypothetical protein  40.28 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2219  hypothetical protein  40.28 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.571769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>