More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5129 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  60.62 
 
 		 786 aa  904    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  53.71 
 
 		 770 aa  770    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 771 aa  1548    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  47.33 
 
 		 743 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  44.61 
 
 		 745 aa  562  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 750 aa  455  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  37.17 
 
 		 759 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  37.01 
 
 		 758 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 758 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 774 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 758 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 		 758 aa  439  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 792 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 728 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 775 aa  330  6e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 790 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 755 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 803 aa  290  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 704 aa  278  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 761 aa  277  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 790 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 765 aa  268  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 792 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 761 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 780 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 780 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 753 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 720 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 722 aa  253  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 730 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 729 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 763 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 730 aa  246  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 784 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.49 
 
 		 739 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 741 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 769 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 728 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 732 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 755 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 783 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 710 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 784 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 804 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 794 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 807 aa  221  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 751 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 764 aa  220  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 796 aa  220  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  27.42 
 
 		 751 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 733 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 771 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.3 
 
 		 755 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 825 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 762 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 809 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 776 aa  214  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 832 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 771 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 817 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 747 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 726 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 725 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 730 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.86 
 
 		 754 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 736 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 730 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 759 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 724 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 808 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 722 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 785 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 794 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 734 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 779 aa  200  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 786 aa  200  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.85 
 
 		 747 aa  200  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  28.81 
 
 		 741 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 749 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 743 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 713 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 723 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 795 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 758 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 769 aa  195  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 777 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  28.1 
 
 		 807 aa  193  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 741 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 761 aa  190  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 732 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 808 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 803 aa  189  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 746 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 771 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 778 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 759 aa  188  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 737 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 773 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  26.99 
 
 		 797 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>