More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5128 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  805    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  54.98 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  52.64 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 433 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  41.22 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  41.86 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 438 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 506 aa  255  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  52.07 
 
 		 578 aa  252  9.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 448 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 470 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 467 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 467 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 442 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 465 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  36.85 
 
 		 472 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.84 
 
 		 475 aa  212  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 461 aa  212  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  35.53 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  35.53 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  34.84 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 443 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 424 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 441 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 456 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 416 aa  163  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 426 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  32.42 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  45.97 
 
 		 542 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 461 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 426 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 464 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 442 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  45 
 
 		 530 aa  146  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 536 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 490 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  31 
 
 		 453 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 441 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 423 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 454 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  33.14 
 
 		 479 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 426 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  32.19 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  33.24 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  32.19 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  32.19 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  32.19 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  32.19 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  32.19 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  32.05 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 450 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>