46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5126 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  253  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  43.75 
 
 		 286 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  45.68 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  44.05 
 
 		 291 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  30.09 
 
 		 284 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  43.84 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  41.33 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  37.35 
 
 		 288 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  36.59 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  34.09 
 
 		 292 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  39.19 
 
 		 289 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  33.65 
 
 		 291 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  33.65 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  41.54 
 
 		 331 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  35.71 
 
 		 290 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  38.81 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  35.94 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  28.85 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  45.61 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  35.29 
 
 		 295 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  38.46 
 
 		 290 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  38.46 
 
 		 290 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  23.08 
 
 		 287 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  36.92 
 
 		 290 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  34.38 
 
 		 290 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  36.92 
 
 		 290 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  36.92 
 
 		 290 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  36.92 
 
 		 290 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  36.92 
 
 		 290 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  36.92 
 
 		 290 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  36.92 
 
 		 290 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  36.92 
 
 		 290 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  35.85 
 
 		 289 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  29.69 
 
 		 288 aa  50.1  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  29.41 
 
 		 292 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  44.07 
 
 		 289 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  28.81 
 
 		 304 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  34.43 
 
 		 292 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  31.65 
 
 		 292 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  27.08 
 
 		 292 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  27.38 
 
 		 293 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  26.61 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  29.36 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  32.14 
 
 		 295 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  23.96 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  25.97 
 
 		 292 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>