67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5118 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  100 
 
 
88 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  77.65 
 
 
89 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  77.65 
 
 
89 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  64.2 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  58.82 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  54.12 
 
 
87 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  51.76 
 
 
87 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  51.76 
 
 
87 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  52.94 
 
 
87 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  51.76 
 
 
87 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  52.33 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  50 
 
 
95 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  48.15 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  45.35 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  47.06 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  43.9 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  45.71 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  44.32 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  44.71 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  56.6 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  42.42 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0721  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.27 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  47.17 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  42.42 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  39.71 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  42.35 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  57.69 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  39.39 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.39 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  39.39 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  39.39 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  39.39 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  39.39 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  39.39 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4201  RelB antitoxin  36.9 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  36.59 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  34.18 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2575  addiction module antitoxin  37.18 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.167878 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  37.35 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0548  putative RelB antitoxin  38.16 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  50.98 
 
 
98 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1084  hypothetical protein  34.18 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.64 
 
 
102 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  44.64 
 
 
102 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  42.86 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  54.76 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  35.09 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  40.82 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0983  RelB antitoxin  33.33 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  42.86 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2078  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.84 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200075  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0017  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  48.84 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  48.84 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4262  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  48.84 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0357  DNA-damage-inducible protein J  39.02 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2071  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  48.84 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.51 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  25.84 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  42.86 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  40.82 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00900  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.78 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
84 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  26.98 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  38.78 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1477  RelB antitoxin  35.09 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.400201  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  34.69 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0511  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  34.43 
 
 
92 aa  40  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>