55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5117 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5117  addiction module antitoxin  100 
 
 		 93 aa  187  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2157  addiction module toxin, RelE/StbE family  72.53 
 
 		 93 aa  144  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541282  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4296  addiction module antitoxin  73.63 
 
 		 93 aa  143  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000000263758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6454  plasmid stabilization system protein  73.63 
 
 		 93 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121069  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1164  addiction module antitoxin  64.84 
 
 		 93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3909  addiction module antitoxin  67.03 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342792  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3781  hypothetical protein  64.84 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36930  addiction module toxin, RelE/StbE family  62.64 
 
 		 93 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4381  addiction module toxin, RelE/StbE family  60.44 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4250  addiction module antitoxin  80 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0906167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2146  addiction module toxin, RelE/StbE family  80 
 
 		 82 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3345  addiction module antitoxin  58.16 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110991  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17080  plasmid stabilization system protein/addiction module toxin  59.34 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2504  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.65 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0970  hypothetical protein  50.54 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0547  putative plasmid stabilisation system protein  44.57 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151138  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2035  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0505  hypothetical protein  45.56 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3186  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.62 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1376  addiction module toxin, RelE/StbE  41.94 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0479  addiction module antitoxin  42.53 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.233146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0253  hypothetical protein  43.62 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3395  addiction module antitoxin  43.62 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11410  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.68 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3382  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.55 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1103  hypothetical protein  45.16 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3886  hypothetical protein  43.01 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0258  hypothetical protein  42.55 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00224  hypothetical protein  42.55 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00220  predicted toxin of the YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  42.55 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4998  addiction module antitoxin  42.39 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0001  addiction module antitoxin  45.9 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000155913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1713  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3768  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.04 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3574  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.78 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0831  PZ12b  38.64 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0303  hypothetical protein  34.07 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.217401  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1196  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.16 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3824  hypothetical protein  40.86 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0223  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.84 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.50496  normal  0.992926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1750  hypothetical protein  37 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00200719  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1495  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.04 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0943  addiction module antitoxin  35.87 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015998  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1860  addiction module antitoxin  33.7 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.998901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1075  hypothetical protein  40.86 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4838  addiction module antitoxin  36.89 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0815  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.72 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2862  addiction module antitoxin  38.1 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0841  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.08 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.37027  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1311  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.648885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0997  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.77 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4250  hypothetical protein  44.74 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0660  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.48 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0508  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  43.48 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0213724 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0199  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.463195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>