More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5099 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  73.71 
 
 		 254 aa  352  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  72.41 
 
 		 251 aa  345  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  70.72 
 
 		 268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  69.82 
 
 		 268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  71.43 
 
 		 270 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  71.43 
 
 		 270 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  68.61 
 
 		 270 aa  307  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  59.29 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  59.29 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  53.07 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  51.54 
 
 		 275 aa  230  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  51.98 
 
 		 274 aa  228  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  52.44 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  72.6 
 
 		 276 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  48.68 
 
 		 276 aa  211  9e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  48.26 
 
 		 293 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  50.72 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  46.88 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  47.77 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  47.77 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  47.77 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  47.77 
 
 		 274 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  47.77 
 
 		 274 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  47.91 
 
 		 275 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  46.88 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  46.88 
 
 		 280 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  45.54 
 
 		 265 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  46.43 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  44.64 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  44.64 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  44.64 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  44.64 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  44.64 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  44.84 
 
 		 274 aa  191  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  44.84 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  44.84 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  46.43 
 
 		 270 aa  190  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  44.2 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  44.21 
 
 		 271 aa  187  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  42.79 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  43.61 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  43.61 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  43.61 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  45 
 
 		 298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  47.39 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  42.5 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 283 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  41.6 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  40.89 
 
 		 251 aa  171  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  40.89 
 
 		 251 aa  171  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  40.89 
 
 		 251 aa  171  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  40.89 
 
 		 251 aa  171  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  40.89 
 
 		 251 aa  171  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  38.84 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  38.84 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  38.84 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  38.84 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  38.84 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  44.25 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  38.84 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  38.84 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  38.84 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>