More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5079 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  81.42 
 
 
113 aa  193  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  66.09 
 
 
115 aa  169  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2996  IS66 Orf2 like  64.35 
 
 
115 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0398  IS66 Orf2 like  66.99 
 
 
145 aa  159  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  62.5 
 
 
116 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  61.61 
 
 
115 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  61.61 
 
 
115 aa  153  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  61.61 
 
 
115 aa  153  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 
115 aa  153  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 
115 aa  153  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  58.93 
 
 
115 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2253  IS66 Orf2 family protein  57.14 
 
 
115 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556164  hitchhiker  0.00787404 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5014  IS66 Orf2 family protein  56.25 
 
 
115 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  56.14 
 
 
117 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  56.14 
 
 
117 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  56.14 
 
 
117 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  56.14 
 
 
117 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  55.36 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  57.66 
 
 
115 aa  134  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3197  IS66 Orf2 family protein  55.75 
 
 
116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3699  hypothetical protein  54.87 
 
 
116 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.603868 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4398  IS66 Orf2 family protein  54.87 
 
 
116 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  54.46 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3595  IS66 Orf2 family protein  57.14 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428006  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1182  IS66 family element, orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1761  IS66 family orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5042  IS66 family element, orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2840  IS66 family element, orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131854  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4861  IS66 family orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1650  IS66 family element, orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0117  IS66 family element, orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.780843  normal  0.658153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0343  IS66 family element, orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000139365  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2932  IS66 family orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2122  IS66 family orf2  54.21 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4291  IS66 family element, orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0069  IS66 family orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1406  IS66 family orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3875  IS66 family element, orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0816  IS66 family orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3136  IS66 family transposase orfB  54.21 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1813  IS66 family element, orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376504  hitchhiker  0.0000000512452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2223  IS66 family element, orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0126387  hitchhiker  0.00000000000242445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3344  IS66 family orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0039  IS66 family orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1309  IS66 family element, orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0020  IS66 family orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4878  IS66 family orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3385  IS66 family orf2  57.28 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3447  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2948  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3097  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00401392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2963  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1005  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0708  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2712  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2602  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2619  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4624  ISEc8 transposase  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4638  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1338  IS66 family element, orf2  53.33 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4659  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.542564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4653  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1002  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0194  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0511  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3676  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0711  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.669363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3414  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0018  ISEc8 transposase  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1116  ISEc8 transposase  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1114  ISEc8 transposase  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.883622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1583  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1641  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1654  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1867  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2414  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2363  ISEc8 transposase  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000786413  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0145  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2637  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3709  IS66 family element, orf2  56.31 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000797988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4275  ISSfl4 ORF2  53.7 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.935918  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  54.95 
 
 
115 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  56.76 
 
 
115 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3898  IS66 family transposase orfB  52.88 
 
 
116 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  50.47 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  50.47 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  50.47 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  50.47 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  50.47 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  50.47 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  54.05 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  54.05 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  54.05 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  54.05 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  54.05 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  50.47 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4294  IS66 family element, orf2  53.33 
 
 
116 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2590  putative transposase, TnpB  55.24 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>