More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5070 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009508  Swit_5070  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
287 aa  587  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3166  IstB ATP binding domain-containing protein  77.39 
 
 
291 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.731238  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3222  IstB ATP binding domain-containing protein  77.39 
 
 
291 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3510  IstB ATP binding domain-containing protein  77.03 
 
 
291 aa  441  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3299  IstB ATP binding domain-containing protein  76.68 
 
 
291 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5625  transposase  76.43 
 
 
274 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426495 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5415  transposase  77.15 
 
 
269 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1831  transposase  76.4 
 
 
270 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0942  transposase  76.4 
 
 
270 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0891094  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3496  transposase  76.4 
 
 
270 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.316856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0314  transposase  76.4 
 
 
270 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6189  IstB ATP binding domain-containing protein  71.97 
 
 
283 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5717  IstB ATP binding domain-containing protein  71.97 
 
 
283 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451064  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2443  putative transposase-associated ATP- binding protein  72.35 
 
 
283 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165117  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2558  putative transposase-associated ATP- binding protein  72.35 
 
 
283 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371505  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2707  putative transposase ATP-binding protein, IstB  72.35 
 
 
283 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3172  putative transposase-associated ATP- binding protein, IstB  72.35 
 
 
283 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290467  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3750  putative transposase-associated ATP- binding protein  72.35 
 
 
283 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.885023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0126  putative transposase-associated ATP- binding protein  72.35 
 
 
283 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0081  putative insertion sequence ATP-binding protein  68.13 
 
 
272 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2666  putative IS21 transposase-associated ATP- binding protein  68.13 
 
 
272 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568551  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1946  putative transposase-associated ATP- binding protein  68.13 
 
 
272 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1787  putative transposase-associated ATP- binding protein  67.33 
 
 
280 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  64.66 
 
 
277 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  64.66 
 
 
277 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  64.66 
 
 
277 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  64.66 
 
 
277 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2702  IstB domain protein ATP-binding protein  61.11 
 
 
267 aa  302  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4193  hypothetical protein  60.08 
 
 
287 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.356635 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0462  IstB ATP binding domain-containing protein  73.71 
 
 
192 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373098  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2027  IstB domain protein ATP-binding protein  57.85 
 
 
275 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2400  IstB domain protein ATP-binding protein  57.85 
 
 
275 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3176  ISAfe9, transposition helper protein  57.85 
 
 
275 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1515  IstB domain protein ATP-binding protein  57.85 
 
 
275 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2775  IstB domain protein ATP-binding protein  57.85 
 
 
275 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  60.83 
 
 
307 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2875  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3548  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4324  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3764  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3790  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3945  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3517  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0252496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3186  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3140  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2871  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2806  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2720  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4344  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4413  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4440  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.57261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0599  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0777  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0813  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1022  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1067  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1127  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1138  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1257  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1578  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1637  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1828  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.703545  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1925  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2020  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2045  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2094  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2141  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2181  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2322  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2647  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2667  IstB ATP binding domain-containing protein  47.33 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3714  IstB ATP binding domain-containing protein  46.91 
 
 
248 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4484  IstB domain protein ATP-binding protein  49.1 
 
 
248 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4735  IstB ATP binding domain-containing protein  72.3 
 
 
164 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02457  putative transposase  43.51 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5450  IstB domain protein ATP-binding protein  44.93 
 
 
236 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.532201 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5325  IstB domain protein ATP-binding protein  44.93 
 
 
236 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.443001 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0041  IstB domain protein ATP-binding protein  44.93 
 
 
236 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0085  IstB domain protein ATP-binding protein  44.93 
 
 
236 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0613596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2282  IstB domain protein ATP-binding protein  44.93 
 
 
236 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  44.93 
 
 
236 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406827  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2113  IstB domain protein ATP-binding protein  44.93 
 
 
236 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4316  IstB domain protein ATP-binding protein  44.93 
 
 
236 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2975  IstB domain protein ATP-binding protein  44.93 
 
 
236 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.44965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3083  IstB domain protein ATP-binding protein  44.93 
 
 
236 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0064  IstB ATP binding domain-containing protein  40.08 
 
 
270 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1622  IstB ATP binding domain-containing protein  40.08 
 
 
270 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  40.7 
 
 
262 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  40.7 
 
 
262 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  41.88 
 
 
255 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  41.88 
 
 
255 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  41.88 
 
 
255 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1326  IstB ATP binding domain-containing protein  51.66 
 
 
166 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  34.55 
 
 
280 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  42.45 
 
 
221 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  33.91 
 
 
252 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  33.91 
 
 
252 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  33.91 
 
 
252 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  33.91 
 
 
252 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  35.29 
 
 
256 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>