More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5039 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  805    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 434 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  42.93 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  43.83 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 434 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 433 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  39.25 
 
 		 415 aa  275  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  32.26 
 
 		 420 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 416 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 418 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 423 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 423 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 447 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 447 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 425 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.86 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  31.83 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 438 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 436 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 444 aa  93.6  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 447 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 479 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 428 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  26.18 
 
 		 436 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 434 aa  86.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 456 aa  86.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 		 427 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 430 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.65 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  22.33 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>