71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5027 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009508  Swit_5027  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  100 
 
 
152 aa  304  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42279  normal  0.634869 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  45.1 
 
 
208 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2974  autoinducer synthesis protein  51.43 
 
 
223 aa  73.6  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.402938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  42.06 
 
 
208 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1650  autoinducer synthesis protein RhlI  40.91 
 
 
202 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2175  autoinducer synthesis protein  49.18 
 
 
212 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.533935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2331  autoinducer synthesis protein  49.18 
 
 
212 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.933975  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  40.21 
 
 
220 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5763  autoinducer synthesis protein  50 
 
 
207 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124199  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19130  autoinducer synthesis protein RhlI  45.9 
 
 
201 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347386  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2312  autoinducer synthesis protein  42.62 
 
 
200 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.362295  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0626  autoinducer synthesis protein  45.9 
 
 
210 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196351  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  40.54 
 
 
204 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5028  autoinducer synthesis protein  45 
 
 
211 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.548856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3320  autoinducer synthesis protein  44.26 
 
 
210 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0959  autoinducer synthesis protein  42.62 
 
 
210 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0369652  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4726  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
202 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455128  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  42.47 
 
 
206 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3641  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
202 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000011065  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  42.86 
 
 
183 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  42.86 
 
 
183 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5574  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
202 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000539644  hitchhiker  0.00691296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1050  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
202 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000000830053  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  42.47 
 
 
206 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  42.47 
 
 
206 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  45.61 
 
 
201 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  42.47 
 
 
206 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4466  autoinducer synthase  47.54 
 
 
207 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5461  autoinducer synthesis protein  43.33 
 
 
201 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4513  autoinducer synthesis protein  43.33 
 
 
211 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4976  autoinducer synthesis protein  43.33 
 
 
211 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  39.73 
 
 
201 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4118  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
213 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000553872  hitchhiker  0.00840845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4583  autoinducer synthesis protein  33.33 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141788  hitchhiker  0.0000655879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  39.73 
 
 
201 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  38.36 
 
 
208 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  35.48 
 
 
188 aa  50.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  36.51 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4152  autoinducer synthesis protein  25.96 
 
 
211 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290737 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  30.4 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  30.4 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  30.4 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  30.4 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  30.4 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  30.4 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  30.4 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  36.07 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0415  putative autoinducer synthesis protein  33.87 
 
 
249 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  30.4 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  34.52 
 
 
218 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  36.49 
 
 
213 aa  43.9  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  32.26 
 
 
237 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  32.91 
 
 
195 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6407  putative autoinducer synthesis protein  40.98 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2851  autoinducer synthetase  32.86 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6377  putative autoinducer synthesis protein  40.98 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  34.43 
 
 
211 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  31.65 
 
 
197 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  26.8 
 
 
218 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  40.32 
 
 
211 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  31.65 
 
 
197 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  23.66 
 
 
197 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0618  N-acylhomoserine lactone synthase  35.94 
 
 
289 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0541466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  37.1 
 
 
212 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2129  autoinducer synthetase BpmI  35.94 
 
 
202 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.466862  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2216  autoinducer synthetase BpmI  35.94 
 
 
275 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0690156  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2022  autoinducer synthetase  35.94 
 
 
202 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0700  autoinducer synthetase BpmI  35.94 
 
 
202 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1577  N-acyl homoserine lactone synthase  35.94 
 
 
202 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4280  autoinducer synthesis protein  32.79 
 
 
207 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0241247  normal  0.0105559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  26.8 
 
 
218 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>