More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4899 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  63.84 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  64.21 
 
 		 275 aa  354  7.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  63.47 
 
 		 274 aa  352  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  59.48 
 
 		 276 aa  332  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  64.07 
 
 		 278 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  58.93 
 
 		 293 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  55.15 
 
 		 268 aa  295  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  55.51 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  56.62 
 
 		 270 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  56.62 
 
 		 270 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  56.62 
 
 		 270 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  56.62 
 
 		 270 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  56.62 
 
 		 270 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  56.62 
 
 		 270 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  56.62 
 
 		 270 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  56.62 
 
 		 270 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  54.23 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  66.18 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  54.04 
 
 		 270 aa  271  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  54.04 
 
 		 270 aa  271  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  53.31 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  54.18 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  59.29 
 
 		 224 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  52.17 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  52.57 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  45.99 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  45.99 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  45.99 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  45.99 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  45.99 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  45.99 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  45.99 
 
 		 274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  45.99 
 
 		 274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  55.45 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  45.62 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  47.89 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  46.35 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  46.35 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  46.35 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  46.36 
 
 		 265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  46.35 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  46.35 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  47.86 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  45.26 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  45.99 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  46.74 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  45.21 
 
 		 295 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  45.21 
 
 		 295 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  45.21 
 
 		 295 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  40.3 
 
 		 298 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  45.26 
 
 		 274 aa  205  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  42.29 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  48.5 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  38.43 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  46.91 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  44.53 
 
 		 271 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  44.75 
 
 		 308 aa  194  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3379  transposase IS4 family protein  37.59 
 
 		 285 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  42.17 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  42.17 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  42.17 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  42.17 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  42.17 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  41.25 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>