291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4865 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  100 
 
 		 324 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  55.34 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  53.11 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  39.23 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  39.66 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  41.18 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  34.18 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  41.77 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  39.51 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  41.63 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  36.36 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  34.6 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  41.74 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  42.86 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  31.04 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  35.54 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  36.79 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  40.41 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  41.53 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  40.96 
 
 		 324 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  40.16 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  37.04 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  35.95 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  33.99 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  35 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  41.05 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  33.88 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  29.97 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  37.75 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  32.94 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  29.28 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  35.27 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  35.1 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  35.26 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  35.26 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  35.26 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  35.26 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  35.26 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  35.26 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  32.24 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  34.05 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  36.59 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  33.33 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  37.04 
 
 		 319 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  36.22 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  32.14 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  30.58 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  35.98 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  31.77 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  31.69 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  28.7 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  34.62 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  26.14 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  33.01 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  32.22 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  30.27 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  31.69 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  25.31 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  30.83 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  28.8 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 310 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  32.53 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  31.34 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  31.91 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  24.38 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  32.28 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  32.28 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  31.44 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  29.86 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  30.31 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  36.46 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  30.56 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  32.46 
 
 		 326 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  32.47 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  34.41 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 660 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1516  putative Type II secretion system protein precursor  37.8 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.0992648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>