141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4824 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  100 
 
 		 216 aa  417  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  51.15 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  50.46 
 
 		 222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  44.74 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  40.85 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  44.85 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  40.6 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  43.88 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  42.22 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  31.5 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  36.69 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  33.58 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  37.76 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.98 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  33.85 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  29.65 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  32.62 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  29.37 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  29.63 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  29.63 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30.99 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  31.98 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  33.86 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  29.35 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  33.15 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  37.25 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  39.13 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  32.62 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  42.39 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  38.14 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  33.09 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  36.81 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  33.17 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  34.71 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  33.12 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  35.77 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  35.17 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  30.1 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  36.22 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  30.66 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  29.59 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  42.22 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  30.14 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  34.31 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  31.14 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  32.41 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  38.85 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  31.93 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  32.28 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  27.61 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  33.85 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  32.2 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1440  signal peptidase I, putative  34.91 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  32.03 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  32.58 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  29.95 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  34 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  39.58 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  37.93 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  32.53 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  32.65 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  39.29 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  30.49 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  36.72 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  31.88 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  41.11 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  38.46 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  28.87 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  37.35 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  28.87 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  32.26 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  38.82 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  28.12 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  28.07 
 
 		 289 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  33.33 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  31.62 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  35.8 
 
 		 265 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  26.85 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  28.17 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  31.58 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  31.62 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  27.67 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  23.47 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  34.48 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  34.18 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  30.08 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  45.33 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  29.55 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  27.52 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  29.94 
 
 		 289 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  36.67 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>