More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4781 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 753 aa  1539    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 763 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  38.13 
 
 		 774 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 704 aa  273  9e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 730 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 710 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 765 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 763 aa  240  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 741 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 724 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 759 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 777 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 751 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 695 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 713 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 755 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 792 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 790 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 720 aa  230  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 733 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.73 
 
 		 715 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 731 aa  221  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 744 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 734 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  28.61 
 
 		 784 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 780 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 784 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 809 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 780 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 802 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 749 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 720 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.1 
 
 		 739 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 790 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 775 aa  213  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 758 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 771 aa  211  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 764 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 753 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 757 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 764 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 758 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 775 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 784 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 808 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 803 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 734 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 755 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.72 
 
 		 755 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 736 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.73 
 
 		 747 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 722 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 786 aa  204  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 771 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 761 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  27.38 
 
 		 822 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 763 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 773 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 730 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 757 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 791 aa  197  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 702 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 783 aa  197  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 780 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 761 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 792 aa  197  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  28.7 
 
 		 785 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 794 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 795 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 717 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 764 aa  195  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 787 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 762 aa  193  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 687 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 785 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 822 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 766 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 780 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 853 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 728 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 788 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 773 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 851 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 700 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 761 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 741 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 746 aa  191  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 796 aa  191  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  27.86 
 
 		 741 aa  190  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 789 aa  190  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 795 aa  190  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 783 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 747 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 759 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 730 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 732 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 753 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 781 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 743 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 786 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>