More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4771 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  100 
 
 
99 aa  197  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  53.49 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  53.47 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  56.25 
 
 
99 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  46.94 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  54.12 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  47.73 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  51.16 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  51.85 
 
 
93 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  44.79 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  44.79 
 
 
97 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  49.46 
 
 
94 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  55.41 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  51.35 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  50.59 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  50.67 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  54.79 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  53.33 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  46.34 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  54.55 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  55.41 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  52.78 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  51.95 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  50 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  46.07 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  54.67 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  40.22 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  56.72 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  40.22 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  52.7 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  47.44 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  50.68 
 
 
98 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  56.92 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  42.86 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  52.94 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  47.5 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  45.88 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  54.79 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  50 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  48.68 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  45.88 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  47.37 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  49.28 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  41.38 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  50.7 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  46.34 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  51.35 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  40.26 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  48 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  46.08 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  42.7 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  45.35 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  52.11 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1853  acylphosphatase  41.56 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  45.57 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1848  acylphosphatase  41.56 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  49.3 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  48.68 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  50 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  45.98 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  49.3 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  52.86 
 
 
90 aa  66.6  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  44.87 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  46.91 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  37 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  41.18 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0599  acylphosphatase  43.04 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  47.37 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  48.57 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  47.37 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  46.48 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  46.05 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  53.62 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  39.53 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  46.05 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  39.51 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  49.3 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  40.51 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  50.7 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  45.07 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  43.53 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  40.28 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  46.48 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  41.67 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  45.68 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  42.68 
 
 
92 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  44.3 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  49.32 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0797  acylphosphatase  40 
 
 
94 aa  62  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.159731  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  44.94 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  46.05 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  45.07 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  49.28 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  40 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  42.17 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  47.89 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  48.65 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  45.68 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  45.68 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  45.68 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>