More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4753 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 296 aa  584  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  60.84 
 
 		 325 aa  345  7e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  47.31 
 
 		 312 aa  245  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  44.95 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  42.56 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  43.12 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  42.01 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  42.75 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  43.23 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.75 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  42.37 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  43.84 
 
 		 310 aa  208  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  43.48 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  43.48 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  41.3 
 
 		 289 aa  201  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  39.62 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  39.62 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  39.62 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  39.62 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  39.62 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  39.62 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  39.62 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  37.91 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  38.77 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  39.25 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  40.77 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  40.75 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  40.75 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  40 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  40 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  40 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  39.25 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  40.38 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  39.62 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  36.96 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  40 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 		 289 aa  195  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  43.32 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  37.54 
 
 		 300 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  39.11 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  41.58 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  42.05 
 
 		 323 aa  191  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  40 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  41.26 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  39.49 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  39.27 
 
 		 297 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  40.51 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  39.71 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  40.07 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  40.7 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  41.03 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  41.03 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.74 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  30.34 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  29.39 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  29.39 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  29.03 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  32.97 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  28.16 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  32.06 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  29.63 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  31.66 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 		 459 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  31.53 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 		 481 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 310 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 488 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  31.75 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 		 460 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  31.39 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  28.17 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  30.47 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  24.38 
 
 		 309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  25.37 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  34.62 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>