More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4719 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 355 aa  706    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  64.14 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  63.43 
 
 		 363 aa  408  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  53.57 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  51.27 
 
 		 446 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  50.7 
 
 		 498 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  52.31 
 
 		 504 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  50.42 
 
 		 498 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  56.1 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  53.96 
 
 		 520 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  52.49 
 
 		 433 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  54.09 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  52.53 
 
 		 355 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  46.94 
 
 		 375 aa  292  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  52.96 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  54.46 
 
 		 331 aa  289  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  51.32 
 
 		 603 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  51.09 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  48.97 
 
 		 399 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  49.54 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  47.55 
 
 		 441 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  50.48 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  46.61 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  47.8 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  46.61 
 
 		 375 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  52.28 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  50.31 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  46.81 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  44.23 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  43.17 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  42.82 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  49.39 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  47.66 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  43.75 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  43.75 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  43.75 
 
 		 378 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  44.25 
 
 		 374 aa  252  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  45.96 
 
 		 378 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  45.75 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  43.34 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  32.29 
 
 		 545 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  32.29 
 
 		 545 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  32.93 
 
 		 549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  31.66 
 
 		 550 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  31.86 
 
 		 523 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  37 
 
 		 318 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  36.93 
 
 		 307 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  33.65 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  36.07 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  35.56 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  31.23 
 
 		 544 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  31.23 
 
 		 544 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  33.76 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  33.44 
 
 		 513 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  27.81 
 
 		 507 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  34.97 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  30.72 
 
 		 557 aa  133  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  35.29 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  34.15 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  30.55 
 
 		 519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  31.79 
 
 		 570 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  33.89 
 
 		 304 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  29.69 
 
 		 544 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  33.65 
 
 		 513 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  33.33 
 
 		 568 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  31.11 
 
 		 539 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  31.09 
 
 		 305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  29.25 
 
 		 550 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  37.38 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  32.57 
 
 		 500 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  34.29 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  34.98 
 
 		 307 aa  126  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  34.84 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  35.5 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  35.33 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  30.29 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  29.19 
 
 		 531 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  33.76 
 
 		 511 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  32.39 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 		 510 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  28.25 
 
 		 531 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  28.89 
 
 		 531 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  28.8 
 
 		 531 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  31.33 
 
 		 545 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0400  Ppx/GppA phosphatase  31.01 
 
 		 303 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  30.84 
 
 		 526 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  30.65 
 
 		 513 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  30.84 
 
 		 526 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  30.84 
 
 		 526 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3162  Ppx/GppA phosphatase  35.05 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  30.54 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  30.52 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  31.35 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  35.76 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  36.54 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  34.15 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  30.94 
 
 		 513 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>