More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4715 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  100 
 
 
348 aa  717    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  79.57 
 
 
329 aa  544  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  80.63 
 
 
332 aa  538  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  63.73 
 
 
320 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  62.54 
 
 
324 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  61.51 
 
 
310 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  61.31 
 
 
323 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  59.42 
 
 
323 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.87 
 
 
330 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  58.86 
 
 
325 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  59.21 
 
 
310 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  60.31 
 
 
320 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  58.86 
 
 
325 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.96 
 
 
334 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.58 
 
 
332 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  59.25 
 
 
322 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  57.98 
 
 
333 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  59.28 
 
 
329 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  56.91 
 
 
312 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.38 
 
 
322 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  55.23 
 
 
328 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  55.56 
 
 
328 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.31 
 
 
317 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.77 
 
 
331 aa  371  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  56.11 
 
 
304 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.68 
 
 
338 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  55.78 
 
 
304 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  55.45 
 
 
304 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  55.12 
 
 
304 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.44 
 
 
310 aa  359  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  54.4 
 
 
313 aa  352  5e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  54.46 
 
 
314 aa  350  2e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  54.43 
 
 
315 aa  338  9e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  54.28 
 
 
311 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  52.1 
 
 
324 aa  333  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  52.08 
 
 
318 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  51.15 
 
 
323 aa  324  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  50.32 
 
 
319 aa  323  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  52.96 
 
 
322 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.97 
 
 
311 aa  322  5e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  50.16 
 
 
321 aa  318  6e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1159  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.7 
 
 
341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0891  quinolinate synthetase  46.25 
 
 
358 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000130385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.91 
 
 
301 aa  287  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  46.73 
 
 
303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0746  quinolinate synthetase  44.15 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1554  quinolinate synthetase  47.24 
 
 
371 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  45.45 
 
 
301 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.4 
 
 
307 aa  281  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.39 
 
 
324 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0256  quinolinate synthetase  46.95 
 
 
357 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  45.45 
 
 
301 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2197  quinolinate synthetase  47.91 
 
 
348 aa  278  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293101  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2327  quinolinate synthetase  48.24 
 
 
382 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0615138 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02681  quinolinate synthetase  46.01 
 
 
345 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000074326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  46.18 
 
 
307 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2449  quinolinate synthetase  47.91 
 
 
382 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0600  quinolinate synthetase  46.65 
 
 
379 aa  277  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.287851  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2717  quinolinate synthetase  47.92 
 
 
382 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.89 
 
 
303 aa  276  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0632  quinolinate synthetase  45.82 
 
 
379 aa  275  8e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2243  quinolinate synthetase  44.07 
 
 
355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  47.06 
 
 
304 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2281  quinolinate synthetase  45.73 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.880932  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1789  quinolinate synthetase  46.54 
 
 
355 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2553  quinolinate synthetase  47.59 
 
 
378 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1901  quinolinate synthetase  46.06 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.115299  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0768  quinolinate synthetase  46.2 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.68917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1895  quinolinate synthetase  47.27 
 
 
378 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2506  quinolinate synthetase  47.27 
 
 
378 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1712  quinolinate synthetase  45.73 
 
 
355 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0567053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1696  quinolinate synthetase  45.02 
 
 
353 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2326  quinolinate synthetase  45.43 
 
 
355 aa  272  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2737  quinolinate synthetase  46.95 
 
 
384 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.919283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1938  quinolinate synthetase  45.59 
 
 
355 aa  272  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0580  quinolinate synthetase  47.28 
 
 
376 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916208  normal  0.575901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0776  quinolinate synthetase  46.32 
 
 
378 aa  272  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2531  quinolinate synthetase  47.27 
 
 
378 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.647299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.5 
 
 
298 aa  271  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2424  quinolinate synthetase  47.27 
 
 
378 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274031  hitchhiker  0.000442231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1319  quinolinate synthetase  45.74 
 
 
378 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2874  quinolinate synthetase  45.98 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0903  quinolinate synthetase  45.82 
 
 
377 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0793  quinolinate synthetase  45.37 
 
 
352 aa  269  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0774972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  46.38 
 
 
304 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  46.41 
 
 
304 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1426  quinolinate synthetase  45.89 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1888  quinolinate synthetase  44.51 
 
 
360 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683594  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0789  quinolinate synthetase  46.6 
 
 
391 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343381  normal  0.0932442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1964  quinolinate synthetase  45.17 
 
 
395 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0730  quinolinate synthetase  45.22 
 
 
353 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2342  quinolinate synthetase  44.51 
 
 
357 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0026  quinolinate synthetase  46.35 
 
 
370 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44147  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1950  quinolinate synthetase  44.82 
 
 
357 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.692849  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  45.87 
 
 
308 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2219  quinolinate synthetase  44.51 
 
 
355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2152  quinolinate synthetase  44.51 
 
 
355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4505  quinolinate synthetase  44.51 
 
 
355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2025  quinolinate synthetase  44.82 
 
 
357 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330504  hitchhiker  0.0000127586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0476  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.71 
 
 
361 aa  266  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00468623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>