More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4714 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  63.95 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  63.48 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  56.67 
 
 		 317 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  55.88 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  56.25 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  48.94 
 
 		 302 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  49.65 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  51.44 
 
 		 310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  51.6 
 
 		 310 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  51.6 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  50.75 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  48.39 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  47.29 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  46.46 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  49.81 
 
 		 315 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  48.2 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  48.13 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  45.33 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  45.33 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  49.43 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  49.06 
 
 		 304 aa  242  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  45.99 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  47.58 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  47.16 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  46.1 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  46.82 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  46.82 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  45.35 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  43.31 
 
 		 313 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  42.36 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  40.42 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  42.71 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.19 
 
 		 285 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  43.93 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  39.93 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  40.37 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  44.2 
 
 		 566 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  44.53 
 
 		 566 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  40.07 
 
 		 282 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 545 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  39.64 
 
 		 568 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 		 263 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  40.73 
 
 		 568 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 		 557 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 		 544 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  37.45 
 
 		 550 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 		 556 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  38.43 
 
 		 288 aa  138  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  37.46 
 
 		 562 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 556 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  35.55 
 
 		 262 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  34.24 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  34.62 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  36.47 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  31.2 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  38.04 
 
 		 270 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.48 
 
 		 259 aa  109  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.57 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.39 
 
 		 258 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  36.09 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  30.5 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  32.76 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  32.17 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 259 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  31.66 
 
 		 259 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 259 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38972 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  33.03 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  33.93 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 257 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  32.05 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 497 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26240  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.08 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.810697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  33.72 
 
 		 497 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  39.38 
 
 		 204 aa  89  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  33.59 
 
 		 500 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 267 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 		 205 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 257 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  33.15 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>