243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4680 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  67.4 
 
 		 191 aa  246  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.96 
 
 		 192 aa  236  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  62.15 
 
 		 189 aa  226  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.56 
 
 		 195 aa  224  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.61 
 
 		 195 aa  215  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.19 
 
 		 194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.91 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.24 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  54.05 
 
 		 189 aa  210  7.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.92 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.22 
 
 		 208 aa  207  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.1 
 
 		 198 aa  207  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.78 
 
 		 208 aa  207  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.91 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.89 
 
 		 191 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.11 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.14 
 
 		 198 aa  205  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.98 
 
 		 191 aa  205  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.22 
 
 		 198 aa  204  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.37 
 
 		 194 aa  204  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.01 
 
 		 209 aa  204  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.25 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.46 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.22 
 
 		 218 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.18 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.55 
 
 		 194 aa  201  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.7 
 
 		 192 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.72 
 
 		 200 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.56 
 
 		 217 aa  200  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.43 
 
 		 217 aa  200  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.8 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.14 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.63 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.81 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.81 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.81 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.95 
 
 		 212 aa  197  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.95 
 
 		 204 aa  197  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.55 
 
 		 190 aa  197  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.74 
 
 		 198 aa  197  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.55 
 
 		 196 aa  197  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.89 
 
 		 200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.11 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.25 
 
 		 193 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.11 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.25 
 
 		 193 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.11 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  53.11 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  53.11 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.89 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  53.11 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.54 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.35 
 
 		 200 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.35 
 
 		 198 aa  195  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.59 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  52.46 
 
 		 191 aa  194  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.37 
 
 		 200 aa  193  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.54 
 
 		 187 aa  194  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.54 
 
 		 191 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.54 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.48 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.51 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.25 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6187  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.28 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.89 
 
 		 191 aa  192  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 187 aa  191  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 		 187 aa  191  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.95 
 
 		 196 aa  191  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6706  methyladenine glycosylase  55.38 
 
 		 222 aa  191  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.16 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  53.63 
 
 		 190 aa  191  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.35 
 
 		 191 aa  190  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 		 187 aa  190  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.46 
 
 		 196 aa  189  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.19 
 
 		 183 aa  189  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.35 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.67 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.69 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.72 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  52.25 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.08 
 
 		 198 aa  187  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.56 
 
 		 212 aa  187  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.22 
 
 		 188 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.22 
 
 		 188 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.05 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.23 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.81 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.17 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  45.6 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2628  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.28 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.19 
 
 		 209 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>