33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4648 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  36.4 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  31.7 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  35.77 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  31.47 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  30.26 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  29.67 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  29.85 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  34.87 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  29.19 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2871  hypothetical protein  36.73 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  34.57 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  32.05 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  31.95 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  30.22 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  29.05 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  30.07 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  32.84 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  34.07 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  29.91 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  32.54 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  32.54 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  30.54 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  29.85 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  29.1 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  29.61 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  27.61 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  31.76 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  31.39 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  28.89 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  31.21 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  31.94 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>