More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4613 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 445 aa  864    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  42.24 
 
 		 471 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  36.41 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  36.18 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  33.64 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  34.9 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  35.9 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  34.76 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  34.76 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  34.76 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  34.76 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  34.76 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  35.14 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  34.76 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  34.76 
 
 		 461 aa  240  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  34.54 
 
 		 461 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  34.07 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  31.58 
 
 		 461 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  32.39 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  33.26 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  32.16 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  34.33 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  34.33 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  32.61 
 
 		 489 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  31.78 
 
 		 490 aa  226  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  32.93 
 
 		 452 aa  226  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  32.93 
 
 		 452 aa  226  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  32.31 
 
 		 501 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  33.41 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  32.31 
 
 		 501 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  33.26 
 
 		 527 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  32.64 
 
 		 501 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  31.39 
 
 		 489 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  31.39 
 
 		 489 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  32.38 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  30.26 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  31.77 
 
 		 490 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  33.18 
 
 		 500 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  31.51 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  31.54 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  31.54 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  30.73 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  31.32 
 
 		 449 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  32.51 
 
 		 489 aa  216  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  30.3 
 
 		 463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  32.44 
 
 		 516 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  31.74 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  30.43 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  34.35 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  31.42 
 
 		 495 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  32.16 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  33.64 
 
 		 464 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  29.7 
 
 		 477 aa  209  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50811  POT family transporter: dipeptide/tripeptide:proton  31.18 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  31.35 
 
 		 463 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  32.55 
 
 		 497 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  34.71 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  32.66 
 
 		 395 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  31.56 
 
 		 501 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  33.41 
 
 		 497 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  30.42 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  31.76 
 
 		 495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  29.4 
 
 		 483 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  29.94 
 
 		 511 aa  186  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  30.04 
 
 		 498 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  32.13 
 
 		 492 aa  183  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  29.78 
 
 		 499 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  29.29 
 
 		 544 aa  182  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  31.91 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  28.9 
 
 		 544 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  30.11 
 
 		 497 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  24.77 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  43.58 
 
 		 584 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  28.63 
 
 		 510 aa  172  9e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  29.64 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  33.02 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  28.43 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  29.64 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  28.22 
 
 		 533 aa  169  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  27.35 
 
 		 507 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  28.09 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  29.64 
 
 		 510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  39.18 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  39.18 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  39.18 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  29.72 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  39.18 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  37.45 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  26.8 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  28.99 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  28.29 
 
 		 517 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  29.59 
 
 		 484 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  27.08 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  28.95 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1174  amino acid/peptide transporter  28.95 
 
 		 521 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  28.95 
 
 		 517 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  26.86 
 
 		 513 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  28.95 
 
 		 546 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  27.94 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>