More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4607 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  100 
 
 		 390 aa  779    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  61.46 
 
 		 390 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  61.2 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  59.42 
 
 		 394 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  56.33 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  39.84 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  34.77 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  36.46 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  35.29 
 
 		 402 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  35.29 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  35.29 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  33.07 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  34.21 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  33.16 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  34.5 
 
 		 402 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  33.6 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  32.08 
 
 		 391 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.6 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  32.67 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  34.4 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  34.92 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.08 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  35.42 
 
 		 385 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.49 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  35.86 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  31.7 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  32.49 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.16 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  33.63 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  33.33 
 
 		 403 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.06 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  33.04 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  35.57 
 
 		 383 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.5 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  30.57 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  33.82 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.93 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  32.64 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  33.79 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.58 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  30.53 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  32.84 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  33.62 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  32.28 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  29.71 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  31.45 
 
 		 390 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  30.9 
 
 		 390 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  29.7 
 
 		 390 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  32.93 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  32.59 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  31.4 
 
 		 389 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  32.94 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.42 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.28 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  30.48 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  32.98 
 
 		 388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  33.73 
 
 		 384 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  29.97 
 
 		 389 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  29.75 
 
 		 392 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  30.4 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  30.45 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  30.99 
 
 		 385 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  32.17 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.81 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  30.51 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  30.4 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  31.4 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  30.53 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  31.9 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  27.35 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  31.84 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  30.75 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  31.11 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  32.77 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  27.35 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  27.27 
 
 		 385 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  30.42 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  30.42 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  30.59 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  34.14 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  28.89 
 
 		 378 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  30.62 
 
 		 397 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  30 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  28.15 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.16 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.16 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.24 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.16 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  29.92 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.16 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  26.98 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.16 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.87 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  31.44 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  26.47 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  34.91 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.44 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.44 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  29.36 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>