54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4601 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  100 
 
 		 295 aa  550  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  40.48 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  42.31 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  38.56 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  26.64 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  36.65 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  35.02 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  40.41 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  39.91 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  35.35 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  35.59 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  32.29 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  35.62 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  35.43 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  31.36 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  31.72 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  33.9 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  28.05 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  27.39 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  31.16 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  28.22 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  31.84 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  28.99 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  28.89 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  29.33 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  27.24 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  26.14 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  32.32 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  35.61 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  31.25 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  25.73 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  28.5 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  35.07 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  30.46 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  32.33 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  33.49 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  30.88 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  34.26 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  32.77 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  31.05 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  31.05 
 
 		 282 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  31.05 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  31.05 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  31.9 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  32.86 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  31.9 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  27.75 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  28.99 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  30.43 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  26.81 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  33.66 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1515  abortive infection protein  33.33 
 
 		 395 aa  42.7  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  31.67 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>