More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4598 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  100 
 
 		 336 aa  674    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  68.97 
 
 		 331 aa  418  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  63.47 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  54.79 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  54.76 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  55.06 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  52.51 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  52.82 
 
 		 344 aa  361  9e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  52.24 
 
 		 356 aa  359  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  52.24 
 
 		 356 aa  359  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  52.24 
 
 		 356 aa  358  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  52.06 
 
 		 350 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  53.43 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  50.15 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  56.27 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  57.54 
 
 		 367 aa  346  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  53.25 
 
 		 353 aa  346  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  49.26 
 
 		 354 aa  342  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  48.82 
 
 		 370 aa  339  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  51.53 
 
 		 351 aa  338  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  51.23 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  50.6 
 
 		 345 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  50.75 
 
 		 353 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  52.41 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  51.5 
 
 		 365 aa  332  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  49.25 
 
 		 352 aa  332  5e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  49.25 
 
 		 352 aa  332  5e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  48.96 
 
 		 348 aa  329  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  54.81 
 
 		 367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  50.61 
 
 		 345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  54.81 
 
 		 367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  51.8 
 
 		 353 aa  328  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  54.81 
 
 		 367 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  50.92 
 
 		 345 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  48.32 
 
 		 350 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  55.1 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  49.7 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  48.32 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  54.52 
 
 		 367 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  54.52 
 
 		 367 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  54.52 
 
 		 367 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  54.52 
 
 		 367 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  49.69 
 
 		 345 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  53.31 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  50.16 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  50.15 
 
 		 363 aa  322  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  50.15 
 
 		 367 aa  322  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  48.2 
 
 		 359 aa  322  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  49.7 
 
 		 370 aa  322  8e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  50.3 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  49.43 
 
 		 371 aa  319  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  49.84 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  50 
 
 		 371 aa  318  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  50.44 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  51.37 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  51.37 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  49.54 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  50.77 
 
 		 369 aa  316  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  52.71 
 
 		 354 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  51.69 
 
 		 365 aa  315  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  51.08 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  48.62 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  49.21 
 
 		 327 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  48.55 
 
 		 343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  48.48 
 
 		 338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  53.01 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  52.71 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  50.79 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  53.31 
 
 		 354 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  48.58 
 
 		 327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  53.31 
 
 		 354 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  48.58 
 
 		 327 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  51.54 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  49.71 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  51.36 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  48.66 
 
 		 378 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  53.61 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  48.24 
 
 		 377 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  48.24 
 
 		 377 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  52.12 
 
 		 398 aa  309  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  49.21 
 
 		 337 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  49.21 
 
 		 337 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  49.85 
 
 		 342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  49.09 
 
 		 371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  48.9 
 
 		 337 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  48.56 
 
 		 371 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  48.9 
 
 		 337 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  50.31 
 
 		 369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  47.08 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  47.26 
 
 		 348 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  47.26 
 
 		 348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  51.08 
 
 		 354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  46.18 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  46.81 
 
 		 348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  50.31 
 
 		 337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  50.31 
 
 		 337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  48.24 
 
 		 377 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  48.28 
 
 		 371 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  46.95 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.62 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>