More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4583 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4583  glyoxylate reductase  100 
 
 
332 aa  661    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  67.67 
 
 
332 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  62.04 
 
 
339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  59.38 
 
 
333 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  58.82 
 
 
330 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000307425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  59.69 
 
 
334 aa  374  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  59.38 
 
 
328 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4126  glyoxylate reductase  58.59 
 
 
333 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  58.46 
 
 
332 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  58.9 
 
 
334 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  58.77 
 
 
334 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  57.67 
 
 
331 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  57.37 
 
 
328 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  57.98 
 
 
334 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  58.59 
 
 
360 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  57.93 
 
 
333 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  57.32 
 
 
357 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  56.07 
 
 
328 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  57.85 
 
 
334 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  57.32 
 
 
333 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  57.85 
 
 
334 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  58.15 
 
 
334 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0073  putative glyoxylate reductase  56.31 
 
 
333 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.692518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  56.1 
 
 
334 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0354  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  56 
 
 
333 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  55.96 
 
 
333 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  56.79 
 
 
331 aa  360  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  56.27 
 
 
333 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  56.88 
 
 
328 aa  359  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0037  2-hydroxyacid dehydrogenase  56.31 
 
 
333 aa  359  4e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  56.04 
 
 
328 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0217  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  55.69 
 
 
333 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.660632  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0045  glycolate reductase  54.77 
 
 
333 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1941  glyoxylate reductase  59.44 
 
 
336 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  decreased coverage  0.00730231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0987  glyoxylate reductase  56.56 
 
 
328 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2313  2-hydroxyacid dehydrogenase  56.56 
 
 
328 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2187  glyoxylate reductase  55.62 
 
 
328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521168  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2390  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.5 
 
 
324 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.129625 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  44.03 
 
 
317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1407  2-hydroxyacid dehydrogenase  46.25 
 
 
323 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.45 
 
 
320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.01 
 
 
327 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  45.69 
 
 
319 aa  255  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2807  glyoxylate reductase  45.45 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.949498 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5114  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.07 
 
 
323 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3322  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.81 
 
 
323 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1815  glycolate reductase  43.61 
 
 
323 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.802319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1872  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.54 
 
 
319 aa  248  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  39.68 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.14 
 
 
318 aa  243  5e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  47 
 
 
327 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.06 
 
 
338 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.27 
 
 
326 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  50.51 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  41.72 
 
 
327 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0625  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.59 
 
 
322 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.9 
 
 
331 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  44.44 
 
 
324 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2082  putative glyoxylate reductase  43.77 
 
 
311 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1325  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.83 
 
 
315 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  41.32 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5902  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic region:D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.85 
 
 
327 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0476763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  46.49 
 
 
322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  42.73 
 
 
341 aa  231  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  45.02 
 
 
274 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  39.12 
 
 
320 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000853458  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2196  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.03 
 
 
316 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00601884  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  41.28 
 
 
322 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.88 
 
 
323 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  42.28 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  40.94 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01261  glyoxylate reductase  44.26 
 
 
357 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  45.21 
 
 
340 aa  225  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  39.94 
 
 
316 aa  224  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.64 
 
 
329 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.06 
 
 
323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.62 
 
 
335 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.25 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  42.32 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  41.38 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2087  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.34 
 
 
312 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.537858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2870  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  43.08 
 
 
352 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  43.89 
 
 
331 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3366  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  43.81 
 
 
315 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2002  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.34 
 
 
312 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.17 
 
 
326 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2926  2-hydroxyacid dehydrogenase  43.42 
 
 
329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  43.09 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3011  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.49 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2281  2-hydroxyacid dehydrogenase  42.03 
 
 
331 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882044  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2941  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.48 
 
 
324 aa  215  9e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.320124 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  35.33 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  42.45 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  42.45 
 
 
346 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  42.45 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2498  glyoxylate reductase  42.45 
 
 
346 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175353  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2371  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.67 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.421154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2328  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.67 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  40.62 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2855  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.58 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>