More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4531 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  100 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  49.75 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  50.57 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  46.05 
 
 		 186 aa  141  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  38.65 
 
 		 196 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  46.1 
 
 		 196 aa  141  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  46.1 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  46.1 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  41.67 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  41.98 
 
 		 195 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  47.4 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  41.45 
 
 		 191 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  47.4 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  44.03 
 
 		 196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  39.9 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  38.69 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  44.44 
 
 		 234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  41.88 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  42.48 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  42.29 
 
 		 220 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  42.86 
 
 		 219 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  43.07 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  43.07 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  40.91 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  39.39 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  46.1 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  41.83 
 
 		 247 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  38.5 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  46.41 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  39.5 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  42.76 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  40.76 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  37.95 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  31.96 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  35.76 
 
 		 178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  33.12 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.84 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  36.42 
 
 		 178 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  35.95 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  30.41 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  44.95 
 
 		 419 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  39.35 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  34.1 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  38.82 
 
 		 455 aa  99  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  38.82 
 
 		 455 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  42.28 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  36.18 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  40.95 
 
 		 439 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  40.8 
 
 		 437 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  31.82 
 
 		 177 aa  88.2  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  30.72 
 
 		 177 aa  88.2  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  38.71 
 
 		 252 aa  88.2  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  34.42 
 
 		 422 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  35.92 
 
 		 426 aa  85.5  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  40 
 
 		 816 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  31.41 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  32.86 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  32.8 
 
 		 495 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  38.89 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  33.33 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  41.82 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  38.4 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  35.43 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  35.66 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  42.02 
 
 		 452 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 495 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  40 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 495 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  35.97 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 324 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  33.59 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  37.5 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  31.74 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  41.84 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  35.9 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  30.87 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  30.87 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  34.51 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  35.82 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  36.17 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  35.9 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.05 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.05 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  29.8 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.05 
 
 		 422 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.46 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  36.61 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.17 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.46 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  31.43 
 
 		 365 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 436 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  34.06 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  30.39 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>