More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4473 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 340 aa  693    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  41.77 
 
 		 327 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  37.69 
 
 		 324 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  41.73 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 		 324 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 		 327 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 327 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  31.27 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  30.52 
 
 		 652 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.51 
 
 		 299 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 705 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 307 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 302 aa  96.3  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 1077 aa  95.9  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  31.35 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.97 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 624 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02870  hypothetical protein  28.44 
 
 		 286 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5047  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 282 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 305 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.16 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  23.3 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  30.73 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 378 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.9 
 
 		 2401 aa  86.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0298  b-glycosyltransferase  25.97 
 
 		 260 aa  86.7  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.917677  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0018  glycosyl transferase  27.87 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 679 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0302  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.128733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 1267 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.04 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 714 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  22.1 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.6 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 		 841 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>