212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4468 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  100 
 
 		 252 aa  500  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  74.49 
 
 		 246 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  72.08 
 
 		 251 aa  351  8e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  65.84 
 
 		 246 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  67.23 
 
 		 264 aa  316  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  57.14 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  51.91 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  56.25 
 
 		 367 aa  247  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  52.34 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  56.6 
 
 		 252 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  55.42 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  50.21 
 
 		 269 aa  242  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  55 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  48.72 
 
 		 268 aa  238  5.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  57.92 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  50.85 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  51.91 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  45.93 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  48.95 
 
 		 282 aa  232  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  56.28 
 
 		 272 aa  231  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  50 
 
 		 279 aa  230  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  45.53 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  45.53 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  50 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  49.58 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  49.58 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  49.58 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  49.58 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  49.15 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  55.74 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  49.58 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  49.58 
 
 		 279 aa  228  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  50.63 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  53.16 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  55.13 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  49.17 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  48.58 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  51.69 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  51.91 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  53.53 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  55.92 
 
 		 267 aa  224  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  47.88 
 
 		 279 aa  224  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  46.61 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  52.03 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  45.45 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  50.83 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  48.13 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  50.42 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  50.84 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  48.1 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  47.41 
 
 		 267 aa  218  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  47.41 
 
 		 267 aa  218  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  57.28 
 
 		 227 aa  218  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  51.04 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  45.78 
 
 		 278 aa  214  8e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  49.58 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  46.47 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  48.31 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  49.37 
 
 		 279 aa  207  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  48.75 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  50.21 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  46.31 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  49.79 
 
 		 246 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  45.53 
 
 		 276 aa  204  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  45.61 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  44.92 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  42.98 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  45.23 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  48.1 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  48.95 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  48.73 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  48.13 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  43.22 
 
 		 270 aa  202  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  47.41 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  48.12 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  50.8 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  48.97 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  49.79 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  54.25 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  47.48 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  47.48 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  48.54 
 
 		 272 aa  198  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0437  hemolysin A  48.52 
 
 		 253 aa  198  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  48.75 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  50.62 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  46.12 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  47.2 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  48.54 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  45.45 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  45.68 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  43.03 
 
 		 284 aa  195  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  47.7 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0777  hemolysin A  51.05 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.850156  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  48.79 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  47.43 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  48.13 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  43.88 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  47.13 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  48.13 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2155  hemolysin A  45.64 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482655  hitchhiker  0.00924028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>