More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4415 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  67.91 
 
 		 268 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  67.16 
 
 		 268 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  72.06 
 
 		 254 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  69.72 
 
 		 251 aa  360  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  65.43 
 
 		 270 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  67.41 
 
 		 270 aa  355  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  67.41 
 
 		 270 aa  355  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  56.62 
 
 		 273 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  56.62 
 
 		 273 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  66.67 
 
 		 276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  51.28 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 274 aa  261  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  48.72 
 
 		 276 aa  248  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  50.37 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  46.55 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  48.08 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  46.89 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  46.89 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  46.89 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  46.39 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  45.05 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  45.42 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  45.05 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  45.05 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  45.05 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  45.05 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  45.05 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  46.89 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  46.89 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  45.05 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  45.05 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  46.77 
 
 		 280 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  44.69 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  45.42 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  47.46 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  45.25 
 
 		 265 aa  222  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  46.01 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  43.23 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  50.72 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  42.44 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  42.26 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  41.34 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  41.92 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  41.92 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  41.92 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3379  transposase IS4 family protein  42.15 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  41.05 
 
 		 294 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  45.38 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  39.61 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  39.61 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  43.02 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  39.61 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  39.61 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  39.61 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  45.56 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  45.31 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  38.37 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  38.37 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  38.37 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  38.37 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>