249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4376 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.36 
 
 		 188 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.44 
 
 		 184 aa  276  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.43 
 
 		 190 aa  274  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.72 
 
 		 184 aa  273  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.72 
 
 		 186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.7 
 
 		 185 aa  265  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.07 
 
 		 186 aa  263  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.17 
 
 		 182 aa  262  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.57 
 
 		 189 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.07 
 
 		 186 aa  261  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.35 
 
 		 206 aa  260  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.75 
 
 		 193 aa  260  8e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.86 
 
 		 176 aa  258  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.46 
 
 		 187 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.57 
 
 		 193 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.93 
 
 		 175 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.43 
 
 		 176 aa  257  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.26 
 
 		 184 aa  256  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.68 
 
 		 187 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.43 
 
 		 189 aa  255  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.81 
 
 		 186 aa  255  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.11 
 
 		 184 aa  254  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.48 
 
 		 185 aa  253  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.54 
 
 		 184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.73 
 
 		 182 aa  250  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.51 
 
 		 175 aa  244  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.79 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.18 
 
 		 184 aa  244  6.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.93 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.98 
 
 		 185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.75 
 
 		 185 aa  238  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.85 
 
 		 185 aa  237  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.42 
 
 		 185 aa  237  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.48 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.3 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 184 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.77 
 
 		 182 aa  234  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.56 
 
 		 188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.8 
 
 		 185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.09 
 
 		 182 aa  231  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.78 
 
 		 189 aa  229  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.84 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 204 aa  228  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 181 aa  227  7e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 		 199 aa  227  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.56 
 
 		 189 aa  227  8e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.36 
 
 		 182 aa  226  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.8 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.24 
 
 		 178 aa  224  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.11 
 
 		 178 aa  222  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 		 178 aa  222  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 		 187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 		 176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.15 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.44 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.22 
 
 		 181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 		 174 aa  217  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.77 
 
 		 181 aa  217  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 175 aa  216  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2558  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.67 
 
 		 188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.01 
 
 		 183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.22 
 
 		 181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.89 
 
 		 188 aa  213  9e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 		 174 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.22 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 		 174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.32 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 		 174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 		 177 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 		 182 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 		 184 aa  211  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.65 
 
 		 172 aa  210  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.76 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 		 174 aa  209  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.54 
 
 		 196 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 		 174 aa  208  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 176 aa  208  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 		 176 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 		 178 aa  208  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.71 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 		 180 aa  207  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.67 
 
 		 182 aa  207  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.82 
 
 		 174 aa  207  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 		 176 aa  206  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0463  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 174 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 176 aa  205  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 174 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 174 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4162  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 174 aa  205  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0434  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 174 aa  205  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3699  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 174 aa  205  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.085186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>