More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4358 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 756 aa  1528    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  45.24 
 
 		 758 aa  646    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  37.86 
 
 		 755 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 763 aa  372  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 771 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 730 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 743 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 773 aa  283  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 704 aa  279  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 710 aa  277  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 734 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 777 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 761 aa  268  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 764 aa  267  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 749 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 737 aa  264  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 822 aa  261  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 782 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  31.06 
 
 		 733 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 722 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 730 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 795 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 767 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 790 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 743 aa  253  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 789 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 746 aa  249  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 741 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 803 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 785 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 747 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 780 aa  246  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 722 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 774 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 773 aa  245  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 764 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 771 aa  244  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 791 aa  242  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 769 aa  242  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 732 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 773 aa  241  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 857 aa  241  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 773 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.38 
 
 		 739 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 810 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 771 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 759 aa  234  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 860 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 809 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 779 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 867 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 748 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  28.5 
 
 		 789 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 779 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 755 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 723 aa  231  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 695 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 761 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 735 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 726 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 767 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 784 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 754 aa  228  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 720 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 790 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 783 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 753 aa  224  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 851 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 769 aa  224  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 780 aa  223  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 725 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 757 aa  221  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 859 aa  220  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 726 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 751 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 762 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 807 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 730 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 785 aa  217  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 717 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 772 aa  214  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 784 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 744 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 766 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 794 aa  211  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.87 
 
 		 747 aa  211  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 792 aa  211  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 700 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 812 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 825 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 780 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 794 aa  207  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 780 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  28.31 
 
 		 776 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 765 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 758 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.28 
 
 		 754 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 728 aa  203  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 767 aa  203  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 789 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>