More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4336 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  100 
 
 
402 aa  790    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  70.32 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.07 
 
 
399 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.5 
 
 
401 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.25 
 
 
401 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.66 
 
 
400 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.41 
 
 
400 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.66 
 
 
401 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.16 
 
 
400 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.41 
 
 
402 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.92 
 
 
400 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
400 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.17 
 
 
400 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
400 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.67 
 
 
400 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.42 
 
 
405 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
400 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.42 
 
 
400 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
405 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
400 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
400 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.41 
 
 
402 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
405 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
405 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.42 
 
 
400 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
405 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.42 
 
 
400 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.92 
 
 
400 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
400 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.67 
 
 
400 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1377  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.41 
 
 
400 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388007  normal  0.268922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.42 
 
 
402 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.25 
 
 
401 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5246  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.92 
 
 
400 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4346  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.16 
 
 
400 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269292  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.92 
 
 
400 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2998  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.92 
 
 
400 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.92 
 
 
402 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4717  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.92 
 
 
406 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5368  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.92 
 
 
400 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4437  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.91 
 
 
400 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228017 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3767  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.17 
 
 
400 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.43 
 
 
412 aa  530  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.17 
 
 
397 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
400 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
400 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.67 
 
 
400 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00256596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2398  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.25 
 
 
404 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2813  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.5 
 
 
404 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.18 
 
 
401 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.18 
 
 
400 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.93 
 
 
400 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.92 
 
 
400 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000820943  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.18 
 
 
400 aa  521  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.93 
 
 
401 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.94 
 
 
400 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.67 
 
 
400 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.43 
 
 
400 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.16 
 
 
400 aa  518  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.66 
 
 
402 aa  521  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.93 
 
 
400 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.68 
 
 
402 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.93 
 
 
400 aa  515  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0472  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.92 
 
 
400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0423781  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.43 
 
 
401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.17 
 
 
399 aa  514  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.93 
 
 
401 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.09 
 
 
400 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.43 
 
 
401 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.17 
 
 
399 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.43 
 
 
401 aa  512  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.68 
 
 
401 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.43 
 
 
401 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0447  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.67 
 
 
400 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.84 
 
 
400 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.18 
 
 
401 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0375  thiolase  62.44 
 
 
401 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000288796  hitchhiker  0.0000265962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.75 
 
 
404 aa  509  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.93 
 
 
400 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.18 
 
 
401 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.68 
 
 
399 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.69 
 
 
401 aa  505  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.17 
 
 
401 aa  507  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5019  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.09 
 
 
400 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.582505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0916  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.16 
 
 
400 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.01 
 
 
401 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.28 
 
 
401 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.68 
 
 
405 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.02 
 
 
402 aa  502  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.69 
 
 
400 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.18 
 
 
406 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.44 
 
 
400 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.69 
 
 
401 aa  498  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.18 
 
 
399 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.02 
 
 
401 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.14 
 
 
404 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.94 
 
 
400 aa  498  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.5 
 
 
401 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.96 
 
 
401 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  62.34 
 
 
402 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>