More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4321 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  100 
 
 
303 aa  607  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  68.75 
 
 
290 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  67.01 
 
 
288 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  66.32 
 
 
288 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  65.61 
 
 
288 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  66.67 
 
 
288 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  66.32 
 
 
288 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  65.97 
 
 
288 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  66.67 
 
 
288 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  63.86 
 
 
286 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  66.43 
 
 
289 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  66.43 
 
 
289 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  66.43 
 
 
289 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  65.97 
 
 
288 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  66.08 
 
 
293 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  63.51 
 
 
286 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  63.51 
 
 
286 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  65.26 
 
 
295 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  63.16 
 
 
286 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  64.93 
 
 
288 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  65.51 
 
 
291 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  64.93 
 
 
288 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  64.93 
 
 
288 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  64.83 
 
 
290 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  63.16 
 
 
286 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  64.93 
 
 
288 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  64.56 
 
 
295 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  64.93 
 
 
288 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  64.93 
 
 
288 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  64.93 
 
 
288 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  63.86 
 
 
295 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  65.02 
 
 
293 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  63.19 
 
 
293 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  62.15 
 
 
288 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  64.56 
 
 
293 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  64.31 
 
 
288 aa  364  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  62.37 
 
 
288 aa  364  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  63.99 
 
 
286 aa  362  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  64.11 
 
 
293 aa  361  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  61.81 
 
 
292 aa  360  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  63.29 
 
 
286 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  63.16 
 
 
288 aa  355  5e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  59.01 
 
 
288 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  59.93 
 
 
305 aa  352  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  60.84 
 
 
287 aa  346  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  59.36 
 
 
286 aa  342  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  58.74 
 
 
290 aa  339  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  52.3 
 
 
287 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  51.06 
 
 
290 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  45.45 
 
 
293 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  49.81 
 
 
286 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  43.71 
 
 
311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1938  pirin family protein  43.51 
 
 
288 aa  222  6e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0765198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  44.62 
 
 
282 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  44.44 
 
 
286 aa  199  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  42.8 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  43.54 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  43.54 
 
 
290 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  43.54 
 
 
290 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  43.54 
 
 
290 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  43.54 
 
 
290 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  43.54 
 
 
290 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  43.54 
 
 
290 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  42.8 
 
 
290 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  43.38 
 
 
292 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  42.44 
 
 
290 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  43.17 
 
 
290 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  43.17 
 
 
290 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  43.84 
 
 
346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  43.17 
 
 
290 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  43.17 
 
 
290 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  43.17 
 
 
290 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  39.68 
 
 
287 aa  188  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  42.95 
 
 
337 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  42.34 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  42.24 
 
 
292 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  42.39 
 
 
322 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  41.7 
 
 
290 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  41.42 
 
 
318 aa  178  8e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  42.41 
 
 
285 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  39.78 
 
 
323 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  41.58 
 
 
320 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  40.15 
 
 
331 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  39.64 
 
 
342 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  42.75 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  43.24 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  39.78 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  38.78 
 
 
328 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  43.3 
 
 
286 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  42.91 
 
 
286 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  40.93 
 
 
324 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  41.03 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  39.93 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  38.57 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  38.31 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.06 
 
 
284 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5014  Pirin domain protein  34.39 
 
 
286 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  39.3 
 
 
289 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  37.6 
 
 
292 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  38.03 
 
 
328 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>