More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4275 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 227 aa  460  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  48.23 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  42.67 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  45.96 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  42.19 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.06 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.86 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.52 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.52 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.52 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.52 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.05 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.73 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  32.55 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.69 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  30.24 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  30.24 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  35.89 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  30.24 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  30.24 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  30.24 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  29.25 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  30.24 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.83 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  30.35 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  34.47 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  28.44 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  29.27 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  29.95 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  29.85 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  29.85 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  29.85 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  29.85 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  29.85 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  27.14 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  31.16 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  31.78 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  29.81 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.6 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  38.53 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.86 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  31.5 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  28.85 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.71 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  29.85 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  35.85 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  35.85 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  28.84 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  29.35 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  29.35 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>