56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4263 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  100 
 
 
366 aa  756    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3086  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  40.8 
 
 
366 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.407832  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  35.56 
 
 
368 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87042 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  27.66 
 
 
178 aa  59.3  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  35.65 
 
 
349 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 
350 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  31.62 
 
 
310 aa  53.1  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  31.46 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  31.46 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  24.45 
 
 
361 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  24.45 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  24.45 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  29.63 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  24.69 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  28.93 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  24.69 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  33.91 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  32.28 
 
 
370 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  32.26 
 
 
348 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  32.71 
 
 
348 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  36.05 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  31.78 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  34.52 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  31.4 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  27.46 
 
 
342 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  33.64 
 
 
283 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  29.49 
 
 
181 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  24.35 
 
 
370 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 
364 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  31.18 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  27.61 
 
 
347 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  27.61 
 
 
347 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  27.61 
 
 
347 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  32.14 
 
 
348 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  31.53 
 
 
324 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  22.77 
 
 
343 aa  46.2  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  30 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  30.08 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 
362 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10191  predicted protein  24.43 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538025  normal  0.129963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  22.22 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  31.69 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  30.97 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 
351 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 
351 aa  42.7  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  27.46 
 
 
344 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>