160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4252 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 344 aa  702    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  36.39 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  33.03 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  34.67 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  33.54 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  36.96 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  32.62 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  32.92 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  33.23 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  35.65 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  35.65 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  35.65 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  32.11 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  33.54 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  30.67 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  32.8 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  33.74 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  30.15 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  32.01 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  39.02 
 
 		 300 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  32.94 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  30.89 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  34.78 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  31.42 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  30 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  29.97 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  31.48 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  34.85 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.14 
 
 		 353 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  31.29 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.54 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  30.82 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  30.82 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  30.9 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  29.5 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  31.79 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.85 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  32.35 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  30.62 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  31.67 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  33 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  31.35 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  31.31 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  32.24 
 
 		 355 aa  122  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  31.16 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  26.71 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  29.81 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  28.62 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  30.35 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  31.67 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  30.95 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  30.95 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  34.02 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  31.6 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  27.55 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  29.72 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  30.67 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  33 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  30.31 
 
 		 341 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  29.41 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  32.66 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  28.7 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  30.07 
 
 		 326 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  28.79 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  32.59 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  28.09 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  28.04 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.48 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  29.35 
 
 		 352 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44178  predicted protein  31.58 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  30.86 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  29.53 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  30.07 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  31.03 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  31.03 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  31.03 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  28.81 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  29.04 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  30.61 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0188  2OG-Fe(II) oxygenase  30.49 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.406722  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  29.19 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  30.2 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  31.27 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  31.27 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  28.66 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.95 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  31.27 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  26.63 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.61 
 
 		 330 aa  96.7  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  28.97 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  29.19 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  29.19 
 
 		 334 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 		 341 aa  92.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  29.49 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>