More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4215 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
271 aa  535  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  41.06 
 
 
278 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.87 
 
 
265 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 
283 aa  125  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  34.54 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  34.54 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
270 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
270 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 
282 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 
270 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  35.02 
 
 
268 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  37.8 
 
 
263 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
270 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  34.93 
 
 
269 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 
264 aa  122  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  33.84 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  34.69 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.53 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  34.22 
 
 
263 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  31.47 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  29.81 
 
 
277 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  32.28 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 
280 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  30.89 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
262 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
264 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  36.48 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 
270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.97 
 
 
425 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
267 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
264 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  32.83 
 
 
271 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  34.1 
 
 
265 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  29.39 
 
 
264 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.09 
 
 
254 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 
261 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  36.11 
 
 
262 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 
263 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 
256 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  32.13 
 
 
259 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 
256 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
273 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  32.05 
 
 
263 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
263 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
295 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
300 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 
256 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
275 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
282 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
340 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
340 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
291 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 
361 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
290 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
276 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  32.44 
 
 
277 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
291 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
340 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
291 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
263 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
279 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
279 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  32.79 
 
 
265 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
309 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 
276 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
284 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
277 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
270 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
333 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  32.22 
 
 
256 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.13 
 
 
261 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
267 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30 
 
 
279 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 
265 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.99 
 
 
275 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  34.9 
 
 
265 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
275 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  33.87 
 
 
268 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.31 
 
 
260 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
257 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  31.75 
 
 
272 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  32.39 
 
 
282 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
345 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
296 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
263 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  30.99 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.62 
 
 
257 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
294 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.62 
 
 
257 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.62 
 
 
257 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>