295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4194 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  100 
 
 		 406 aa  815    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  63.24 
 
 		 425 aa  498  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  55.94 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  45.43 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  43.81 
 
 		 416 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  43.7 
 
 		 391 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  44.42 
 
 		 415 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  43.35 
 
 		 412 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  43.56 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  41.67 
 
 		 420 aa  292  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  42.41 
 
 		 417 aa  292  9e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  41.73 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  42.4 
 
 		 413 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  42.4 
 
 		 413 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  41.95 
 
 		 419 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  41.71 
 
 		 419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  40.73 
 
 		 405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  42.16 
 
 		 413 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  42.35 
 
 		 413 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  41.12 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  41.63 
 
 		 414 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  42.61 
 
 		 428 aa  279  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  41.15 
 
 		 418 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  40.1 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  37.92 
 
 		 412 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  38.31 
 
 		 412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  40 
 
 		 411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  40.2 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  42.39 
 
 		 393 aa  265  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  38.56 
 
 		 409 aa  262  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  38.46 
 
 		 411 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  42.86 
 
 		 405 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  37.72 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  39.18 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  35.08 
 
 		 440 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  33.41 
 
 		 445 aa  216  9e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  35.82 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  34.12 
 
 		 420 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  33.88 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  33.65 
 
 		 482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  31.39 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  31.25 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  32.63 
 
 		 433 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  30.75 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  34.19 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  30.71 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.41 
 
 		 430 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  33.24 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  33.25 
 
 		 486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  35.32 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  30.59 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  34.52 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  33.72 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  30.95 
 
 		 429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  32.63 
 
 		 456 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  33.49 
 
 		 478 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.95 
 
 		 451 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  33.06 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  30.45 
 
 		 430 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  31.85 
 
 		 426 aa  176  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  31.86 
 
 		 441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  31.96 
 
 		 438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  34.12 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  33.98 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  31.95 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  33.09 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.78 
 
 		 444 aa  169  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  32.04 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  34.03 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  31.25 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  32.78 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.86 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  34.95 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  28.95 
 
 		 407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.01 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  31.49 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  30.94 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  32.47 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  30.15 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.76 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.98 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  32.36 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  28.26 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  29.98 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  34.63 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  34.13 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.58 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  26.94 
 
 		 459 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  30.94 
 
 		 459 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  34.39 
 
 		 408 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  34.39 
 
 		 408 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  34.39 
 
 		 408 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  33.07 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  29.84 
 
 		 447 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  30.75 
 
 		 409 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  28.67 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  30.07 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  31.11 
 
 		 426 aa  143  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  31.89 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  33.08 
 
 		 423 aa  142  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>