More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4171 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  844    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 486 aa  216  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 420 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 418 aa  190  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  32.32 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 412 aa  160  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 416 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 430 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  32.51 
 
 		 427 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  30.17 
 
 		 434 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 442 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  32.44 
 
 		 404 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 437 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  29.21 
 
 		 425 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 459 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  29.36 
 
 		 429 aa  114  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  29.36 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  26.7 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  29.34 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 427 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 428 aa  103  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.39 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.74 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  25.12 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 409 aa  97.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 428 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 437 aa  96.3  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  25.14 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  27.81 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  27.81 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  27.81 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  27.25 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 418 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  25.94 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 412 aa  87.4  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 417 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5218  Permeases of the major facilitator superfamily  26.74 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  25.62 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>