42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4122 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4122  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0992  hypothetical protein  45.36 
 
 		 185 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.55 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.5 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1001  putative ring-cleavage dioxygenase  40.57 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7428  ring-cleavage extradiol dioxygenase  36.07 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0442338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6465  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.5 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124478  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.09 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.894491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 		 161 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0104076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0290  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.12 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0505928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.88 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.824084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  26.52 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.35 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5584  putative metapyrocatechase (MPC) (CatO2ase) (catechol 2,3- dioxygenase)  25 
 
 		 297 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.5 
 
 		 159 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4885  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 		 150 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3206  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.29 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000404623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000507937  unclonable  0.00000000000000144798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2217  hypothetical protein  29.5 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.54 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.93 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000520139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 130 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0668  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.66 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.74 
 
 		 295 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.986449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.71 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623689  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 311 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4060  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.66 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.22 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  0.0694487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.65 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000178969  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2322  glyoxalase family protein  29.92 
 
 		 138 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000000100252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2299  glyoxalase family protein  29.92 
 
 		 138 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000195056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0131  glyoxalase family protein  29.92 
 
 		 138 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000275668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0115  glyoxalase family protein  29.92 
 
 		 138 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000344124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2248  glyoxalase family protein  29.92 
 
 		 138 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384082  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2837  glyoxalase family protein  29.92 
 
 		 138 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000107738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0321  glyoxalase family protein  29.92 
 
 		 138 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000322119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0114  glyoxalase family protein  29.92 
 
 		 138 aa  42  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000210861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.65 
 
 		 137 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000152154  decreased coverage  0.00078643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>