More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4070 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 385 aa  757    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  46.86 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  51.87 
 
 		 686 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  46.77 
 
 		 606 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  35.23 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  45.13 
 
 		 2145 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  47.93 
 
 		 1400 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  38.62 
 
 		 950 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 		 5171 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  46.33 
 
 		 946 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.2 
 
 		 3427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.32 
 
 		 2105 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  36.22 
 
 		 1287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  43.03 
 
 		 1164 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.45 
 
 		 1795 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  43.5 
 
 		 2954 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.38 
 
 		 980 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  38.17 
 
 		 1197 aa  109  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.1 
 
 		 2667 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.6 
 
 		 1236 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.94 
 
 		 1963 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  39.69 
 
 		 813 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  38.28 
 
 		 709 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  41.54 
 
 		 1424 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  37.98 
 
 		 341 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.94 
 
 		 588 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  37.66 
 
 		 1895 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.93 
 
 		 1279 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.14 
 
 		 2678 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  37.35 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  42.44 
 
 		 639 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  43.67 
 
 		 202 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  43.67 
 
 		 202 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  35.75 
 
 		 589 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.36 
 
 		 938 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  43.79 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  41.62 
 
 		 613 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  31.93 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  37.33 
 
 		 982 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  37.45 
 
 		 2775 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  36.79 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.34 
 
 		 3954 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  40.44 
 
 		 4334 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.22 
 
 		 1363 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  42.71 
 
 		 595 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  38.8 
 
 		 833 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  35.19 
 
 		 795 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  51.64 
 
 		 1175 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.56 
 
 		 1016 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.84 
 
 		 1532 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  35.2 
 
 		 1712 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.14 
 
 		 556 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.5 
 
 		 421 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  37.07 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  42.41 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  39.37 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  42.29 
 
 		 724 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  40.44 
 
 		 561 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 		 245 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  40.28 
 
 		 686 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.07 
 
 		 2668 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  33.91 
 
 		 2885 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  41.52 
 
 		 1534 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  40.31 
 
 		 1383 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  39.64 
 
 		 742 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  36.32 
 
 		 526 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  43.02 
 
 		 2689 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  45.21 
 
 		 280 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  43.36 
 
 		 615 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  46.32 
 
 		 3619 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.32 
 
 		 3619 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  43.59 
 
 		 327 aa  93.2  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  33.22 
 
 		 303 aa  92.8  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  38.29 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  39.71 
 
 		 1079 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  41.77 
 
 		 572 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  42.37 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  40.5 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  39.31 
 
 		 757 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  43.14 
 
 		 257 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  34.49 
 
 		 1043 aa  90.5  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  37.13 
 
 		 219 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  40.36 
 
 		 243 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  38.31 
 
 		 4800 aa  89.4  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  36.82 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  37.43 
 
 		 680 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  41.1 
 
 		 679 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  39.34 
 
 		 232 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  36.84 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  37.72 
 
 		 518 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  40.94 
 
 		 729 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  32.9 
 
 		 534 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  33.62 
 
 		 1883 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  38.07 
 
 		 850 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  31.16 
 
 		 453 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  41.88 
 
 		 219 aa  86.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  38.59 
 
 		 582 aa  86.7  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  41.1 
 
 		 585 aa  86.7  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>