21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4065 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  100 
 
 
224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  31.07 
 
 
284 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  27.31 
 
 
307 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  27.87 
 
 
307 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  26.75 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  26.64 
 
 
308 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  25.66 
 
 
255 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  27.83 
 
 
303 aa  52.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  25.56 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  28.21 
 
 
477 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  23.14 
 
 
789 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  34.57 
 
 
354 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  35.53 
 
 
535 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  25.22 
 
 
395 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  25.13 
 
 
360 aa  45.1  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  25.32 
 
 
405 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  24.37 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  35.94 
 
 
814 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  41.3 
 
 
496 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  25.69 
 
 
268 aa  42  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  25.71 
 
 
272 aa  41.6  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>