220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4038 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 396 aa  788    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  53.37 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  51.42 
 
 		 410 aa  329  6e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  43.89 
 
 		 401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  40.4 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  42.72 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  43.53 
 
 		 429 aa  289  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  44.16 
 
 		 429 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  44.89 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  42.89 
 
 		 406 aa  279  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  44.75 
 
 		 417 aa  269  8e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  43.43 
 
 		 413 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  40.15 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  43.29 
 
 		 394 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 		 413 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  35.08 
 
 		 376 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 360 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  37.55 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  28.89 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  37.08 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  25.06 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  39.04 
 
 		 407 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 411 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  23.38 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  28.13 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  32.03 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  27.56 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  24.81 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  21.5 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 409 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  28.09 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  36.2 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 		 405 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  36.42 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 410 aa  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  29.15 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  32.89 
 
 		 700 aa  86.7  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  30.82 
 
 		 1119 aa  86.3  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  27.38 
 
 		 402 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 		 1340 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  27.16 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  23.86 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 956 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  23.13 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 691 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  20.1 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 1156 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  22.53 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 691 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  31.19 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 		 1106 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  21.99 
 
 		 994 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 703 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0563  hypothetical protein  29.06 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>